在电影开始开篇，场景似乎被设置在一片大森林中。在森林内, 一声强力的呼救被一个叫Yukinari的男孩听到了。Yukinari是一个在残暴社会中比较天真的男孩，但此次经历对他来说是可能使他终身受益。
当他进入森林的时候,他遇见一个叫Mika的少女。Mika也许是森林的监护人, 并且与 Celebi（雪拉比）很要好。一些砍木工人给这里带来了麻烦，Yukinari将帮助Mika摆脱这些砍木者。这时Mika向Yukinari解释了森林现在存在的危险，以及他们必须在有限的时间内寻找她所需要的某个谜底。忽然，雪比拉出现了，将他们带入了40年后的时代。
在那里，他们遇见了我们的英雄（主角）Ash，Misty和Brock。并且，似乎Ash和Yukinari还有某种血缘关系。与此同时，火箭队的成员之一Bisashu也在积极的寻找着雪比拉。这个男人带着一个金属头盔站在...
